【从第零卷·黑历史篇截至第一卷前略·不知何时进入了幻想乡·终章】
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【注1：严正警告，未看正文的请赶紧叉掉，本篇内含严重剧透。】
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【注2：纪年表内只记录了故事主线中的小部分事件，并不完全。】
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幻想历301年1月1日，先代博丽巫女意外死亡，博丽大结界受创。巫女的养女——12岁的灵梦继承博丽巫女之位。
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幻想历301年1月2日，上白泽慧音应八云紫要求隐藏掉了尚未成长的巫女博丽灵梦的全部历史，其存在被除八云紫和慧音之外的所有人忘记。
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幻想历301年5月21日，莫茗意外来到幻想乡，并被八云紫要挟照顾小巫女灵梦，成为家庭教师。
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幻想历301年5月22日，莫茗做的锅巴卖了一枚金锭。同日，莫茗向博丽灵梦作以自我介绍。
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幻想历301年6月2日，莫茗前往村子里考察夜市，第一次与小夜雀妖怪米斯蒂娅·萝蕾拉相遇，并解决了对方的困境。
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幻想历301年6月12日，莫茗决定前往村里夜市摆摊营生来养活自己和小巫女，并获赠阴阳玉作为防身物。
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幻想历301年6月24日，莫茗打算买一头奶羊以提供给灵梦新鲜的羊奶当早餐和晚餐。但考虑到财政问题，次日仅购买了一只小羊羔拴在了神社后院。
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幻想历301年6月27日，博丽灵梦第一次在莫茗面前头痛发作，求医无果后莫茗与八云紫首次交涉，并了解到了信仰对于巫女的重要性。
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幻想历301年7月1日，博丽灵梦前往魔法森林寻找已经忘记掉她的存在的雾雨魔理沙。二人再次成为朋友。
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幻想历301年7月2日，雾雨魔理沙造访神社，并认识了灵梦的老师莫茗。
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幻想历301年7月19日，八云紫修补博丽结界初步完成，交给式神八云蓝打理。同日，八云紫前往博丽神社向博丽灵梦提出开始巫女的修行。
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幻想历301年7月25日，魔理沙与莫茗在神社的玄关前小憩，看着飞在天空中进行修行的灵梦，魔理沙下定决心要提前学会使用扫把飞行。同日，在灵梦的帮助下魔理沙第一次飞上了天空。
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幻想历301年7月25日，莫茗拜访村里名家稗田氏第九代当家，进一步了解了博丽的往事，并从稗田阿求的口中得知了博丽札记的存在。
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幻想历301年8月20日，博丽灵梦又一次在上课时头痛发作。同日，莫茗在杂货间找到了博丽札记，从其上的记载中知道了巫女可以自由开启博丽结界以使他人往返外界。
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幻想历301年10月2日，莫茗在村子里认识了另外一名外来人，一名来自于另一个世界的科学家，并因此了解到了异世界存在的可能性。
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幻想历301年12月21日，在一次八云紫拜访神社时莫茗表示灵梦已经学的很不错，很好的成长为了一个普通的女孩。自己也已经打算不久之后返回外界，并告知自己对于博丽巫女的信仰问题也许有了可行的解决办法。
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幻想历301年12月29日，莫茗前往雾之湖的大图书馆，了解了世界之间时间演变的差异，并从科学家出求证了自己的一些设想。
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幻想历302年2月1日，莫茗再次找到八云紫，提出了在大结界上刻画法阵从异世界汲取信仰的详细方案，被八云紫接受采纳。
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幻想历302年4月，在八云紫忙于在大结界上刻画接收信仰的法阵这段期间，莫茗不断往返大图书馆，暗中与科学家研究自主选择穿越到高度不对等时间比的异世界的方案，且最后拜托帕秋丽制作了一个特殊用途的魔法卷轴。
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幻想历302年5月20日，莫茗与灵梦坐在神社的玄关前小憩时，拒绝了灵梦想让其成为式神的邀请，并约定了“如果可能的话，会尽量（在死之前）赶回幻想乡”。同日，博丽灵梦在谈话中受到启发，为“弹幕机制”的诞生埋下伏笔。
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幻想历302年5月22日，莫茗与灵梦参加了太阳花田一处妖怪们的宴会。莫茗从八云紫处确定了法阵已经刻画完成后，故意激怒八云紫，以保证自己能被灵梦通过开启结界送至异世界。同日，莫茗从八云蓝处收到了一颗可以延缓衰老的丹药。
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幻想历302年5月23日，莫茗收下了灵梦头上的缎带，包含着巫女的祝福的礼物，作为临别赠礼，在博丽灵梦开启大结界后悄悄离开了幻想乡。
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【第零卷·以上】
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幻想历303年11月1日，在一次修行的较量中灵梦与使出了八成实力的八云紫打成平手。察觉到蹊跷的八云紫追踪莫茗至异世界，发现了莫茗的所作所为。此刻莫茗已然身故。
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幻想历303年12月1日，至此日其灵梦每时每刻收到的信仰约为2100亿单位（一个普通人提供1单位的信仰）。返回至幻想乡的八云紫发现灵梦已经成为了半神之躯，察觉到不妙后再次前往异世，教给了已故的莫茗的一名养女——正在学习魔法的女孩成为不老的魔女的方法。并传授了她一些人体炼成的知识。同日，八云紫囚禁住莫茗未散的灵魂并将其勉强复活后带回幻想乡。
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幻想历303年12月2