东瀛的经济间谍活动利用东瀛派往米国大学的留学生和学者，搜集米国学术机构的相关科学技术研究情报。
上世纪80年代，加州大学伯克利分校教授约翰逊称，加州大学的东瀛留学生曾对他说，东瀛驻旧金山的领事官员要求他们报告有关生物科技研究方面的情况，加州大学在这一领域处于世界领先地位。
1990年秋，麻省理工学院一名研究人员称。一些东瀛留学生收到来自东京的命令，试图渗入麻省理工学院一些实验室的研究小组。
1999年6月，在米国克利夫兰医学中心工作的东瀛学者芹泽广明和冈本隆斯辞职回国。任职于东瀛理化学研究所。两年后，米国指控这两名东瀛学者从克利夫兰医学中心偷梁换柱，盗走了一批与老年痴呆症有关的基因物质，并交给其任职的东瀛理化学研究所。
中情局前官员约翰.奎因曾这样总结东瀛政府经济间谍的活动：“大规模、精细、持续”。由于东瀛经济间谍的持续高效活动。以至于有米国专家惊呼。东瀛人只花了数十亿美元，就几乎把西方所有技术都搬回东瀛了；而这笔钱仅相当于米国每年科研费用的十分之一。
东瀛跨国公司的经济间谍还成功获取不少中情局的绝密文件，甚至包括有关“星球大战计划”的绝密技术情报。
1985年，米国科学应用公司项目经理罗纳德.霍夫曼将该公司为“星球大战计划”秘密研发的一套软件程序以75万美元的价格卖给东瀛跨国公司尼桑汽车公司、三菱电子、三菱重工和石川岛播磨重工，这套软件后来被用于东瀛民用航空计划。
1982年，米国国家.安全局在截获三菱公司华盛顿分部发往东京的一份情报后进行了破译和翻译，结果令人震惊：这份情报竟然是中.央情报局呈交米国总统和国家.安全委员会成员的有关两伊战争的绝密级每日情报简介。
上世纪80年代中期，克莱德.普里斯托维茨担任米国商务部贸易谈判代表期间。一直很奇怪日方谈判代表为何知道米国代表团内就半导体谈判存在分歧，而且对他的谈判底线一清二楚。普里斯托维茨不知道东瀛官员是怎样掌握相关情报的。但他和其他米国官员都猜到他们肯定遭到窃听，每次要打重要电话时都到米国驻东瀛大使馆内使用安全线路。
实际上，在上世纪80年代，东瀛在米国国务院内部就拥有了自己的高级情报来源，这使得东瀛政府甚至比米国其他政府部门还要更早掌握米国在某些问题上的谈判立场。
同一时期，对于在东瀛的米国商人来说，这种事实在司空见惯。一名米国商人称，在上世纪90年代的一次贸易谈判中，公司的安全小组坚持对其酒店房间进行安全检查，结果在一个插座后面发现了窃听器。后来，他们基本上避免在东瀛酒店里打重要电话，而且在他们看来，酒店的传真机也处于东瀛经济间谍监控之下。他们还猜想，当地清洁工和其他雇员都会搜集和偷窃情报，每到晚上，他们都会把机密文件锁起来。
在经济间谍活动上，东瀛公司与政府之间建立了密切的合作关系。
1981年，东瀛日立公司从一名前i韩云m雇员手中获得了一些垂涎已久的秘密技术文件最新一代电脑308x系列部分设计资料，这是当时i韩云m公司的最高机密。该案曝光后，被称为“20世纪最大的经济间谍案件”，米国舆论称，对米国硅谷的攻击不亚于当年对珍珠港的偷袭。
事后，数名i韩云m公司官员被捕，日立公司则通过庭外和解，以3亿美元的代价了结了这宗官司。值得一提的是，在这一案件中，负责此次间谍行动的日立公司间谍头目是通过东瀛外交邮件系统向其在旧金山的下属发送指令，而东瀛驻旧金山领事官员则奉命跟进该案。
东瀛经济间谍的手法常常充满欺骗性。比如，大名鼎鼎的东瀛nhk电视台在帮助东瀛获取米国生物技术公司的秘密技术方面就曾扮演了重要角色。nhk工作人员以拍摄纪录片为名义，获准进入几家米国生物科技公司进行拍摄。
进入21世纪以来，东瀛经济间谍活动仍很活跃。
自2001年起，为了加强遗传基因、纳米技术等尖端领域的情报收集，东瀛文部科学省和经济产业省分别从大学及产业研究人员中挑选“合作者”。其中，文部科学省重点在基础研究领域，选择了1 人，经济产业省着重于应用研究领域，要求“合作者”收集技术开发方面的情报。
作为东瀛科学技术的最高权力机构，东瀛综合科学技术会议也与十几名活跃在一线的研究人员签订合同，建立独立的情报网，并委托民间咨询机构调查主要国家科技战略和政策的动向。
2003年，东瀛文部科学省成立“研究开发战略中心”，中心主任由名古屋大学研究生院教授、诺贝尔化学奖获得者野仪良治担任。通过各种数据库、信息网及与私人联系，该中心工作人员分析各国科学技术的发展状况，搜集各国正在实施的科研项目、最新成果，分析选择东瀛需要重点发展的领域及应采取的措施等。
可以看出，东瀛的经济间谍活动一直都有非常清晰的目标，在不同时期，确立不同的重点