说起科尔沁部，他们对大明同样是血债累累，又一个屠杀大明军民的罪魁祸首。
明天启四年，科尔沁部首领与努尔哈赤，刑白马乌牛正式结盟，这也是蒙古大汗第一次失去哈撒儿后裔的支持。
随后按盟旗制度划分固定的牧场，设置哲里木盟十旗。
科尔沁一部6旗；郭尔罗斯一部2旗；扎赉特一部1旗；杜尔伯特一部1旗，其领主各封亲王、郡王等爵位，诏世袭罔替。
科尔沁部在东掳入关和征服各部落的战争中，披坚执锐，冲锋陷阵，为东掳王朝的建立和巩固立下了汗马功劳。
因此位列二十四部之首，爵高位尊，俸银俸缎均高于其他蒙古各部，是东掳统治的重要依靠力量，与满州贵族的关系也最为紧密。
公元1614年，皇太极娶科尔沁部莽古思女哲哲为妻，后尊为孝端皇后，次年，努尔哈赤又娶科尔沁台吉洪果尔女为妻。
公元1623年，科尔沁台吉洪果尔以女送阿济格，科尔沁台吉阿尔寨送女多尔衮。
公元1625年，科尔沁台吉宰桑将其女布木布泰嫁给皇太极为妻，后被尊为孝庄皇后。
9年后布木布泰26岁的姐姐（海兰珠）也嫁给了皇太极，可谓是姑侄女3人同嫁一夫。